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腸道細菌是體內氫的唯一來源，機體內大量的腸道菌群每天可以通過發酵未被吸收的碳水化合物來產生大約150mL的氫氣，隨后排泄出人體或者被結腸菌群吸收而進一步代謝。與其余氣體性細菌產物相比,氫氣能夠改善腸管的運動性而抗菌治療能夠顯著減少腸道氫氣的產生。小鼠胃和肝臟的氫分子濃度為20~80μmol/L,這些氫分子被血液吸收后運送到身體各部分，發揮內源性抗氧化物質的作用。

雖然人類和許多動物的胃腸道本身可以產生氫氣，但到目前為止，并沒有證據證明它有明顯的治療效果。然而研究表明,通過誘導胃腸道產生更多的氫氣，可以治療一些疾病。Kajiya等研究發現,通過給動物補充可產生氫氣的細菌,誘導胃腸道產生更多氫氣，可以抑制ConcanavalinA誘導的肝臟炎癥反應。該研究者還發現，通過飲用富氫水可以獲得比誘導胃腸道產生氫氣更有效的治療效果。與補充外源性氫相比，內源性氫效力低并且產氫菌的腔內管理有細菌過度生長的風險。所以，目前大多數的研究主要是圍繞補充外源性氫開展的。

已有研究表明，運用氫分子治療可以改善葡聚糖硫酸鈉(DSS)誘導的小鼠炎癥性腸病，小鼠結腸短縮、體重減輕的情況明顯好轉。氫分子可以抑制 DSS介導的結腸組織破壞，炎癥細胞對黏膜層的浸潤也明顯減少，但其確切機制尚未完全明確,本課題組正對其展開深入研究，為氫分子用于炎癥性腸病的臨床治療提供重要的理論支持。